Audit Tahap II merupakan proses evaluasi terhadap implementasi dan efektivitas sistem manajemen yang telah diterapkan organisasi. Audit dilaksanakan secara langsung di lokasi organisasi untuk memastikan bahwa seluruh persyaratan standar telah diterapkan secara konsisten dan efektif.

Ruang lingkup Audit Tahap II meliputi:

• Verifikasi kesesuaian penerapan seluruh persyaratan standar sistem manajemen atau dokumen normatif yang menjadi dasar sertifikasi.

• Evaluasi hasil pemantauan, pengukuran, pelaporan, dan tinjauan kinerja organisasi terhadap sasaran serta target yang telah ditetapkan.

• Penilaian kemampuan organisasi dalam memenuhi persyaratan hukum, regulasi, serta kewajiban kontraktual yang berlaku.

• Evaluasi pengendalian operasional terhadap seluruh proses yang berada dalam ruang lingkup sistem manajemen.

• Verifikasi pelaksanaan audit internal dan tinjauan manajemen sebagai bagian dari proses peningkatan berkelanjutan.

• Penilaian komitmen dan tanggung jawab manajemen terhadap kebijakan, sasaran, serta efektivitas sistem manajemen.

Selain itu, auditor juga mengevaluasi keterkaitan antara persyaratan standar, kebijakan perusahaan, sasaran dan target kinerja, pemenuhan regulasi, kompetensi personel, efektivitas prosedur operasional, data kinerja, hasil audit internal, serta tindakan perbaikan yang telah dilakukan organisasi.